Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mterf1aQ8CHZ9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mterf1aQ8CHZ9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mterf1aQ8CHZ9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mterf1aQ8CHZ9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mterf1aQ8CHZ9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mterf1aQ8CHZ9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mterf1aQ8CHZ9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mterf1aQ8CHZ9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mterf1aQ8CHZ9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mterf1aQ8CHZ9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mterf1aQ8CHZ9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Mterf1aQ8CHZ9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms