Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEL2

Cfap61, Cilia- and flagella-associated protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 1,252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap61Q8CEL2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cfap61Q8CEL2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfap61Q8CEL2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cfap61Q8CEL2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.2 ms