Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam228aQ8CDW1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam228aQ8CDW1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam228aQ8CDW1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms