Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Alx1Q8C8B0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Alx1Q8C8B0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Alx1Q8C8B0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Alx1Q8C8B0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms