Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Bhlhe22Q8C6A8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bhlhe22Q8C6A8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms