Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Ubqln3Q8C5U9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubqln3Q8C5U9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Ubqln3Q8C5U9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Ubqln3Q8C5U9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Ubqln3Q8C5U9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Ubqln3Q8C5U9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubqln3Q8C5U9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Ubqln3Q8C5U9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Ubqln3Q8C5U9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Ubqln3Q8C5U9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms