Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cwc22Q8C5N3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Cwc22Q8C5N3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cwc22Q8C5N3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cwc22Q8C5N3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cwc22Q8C5N3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cwc22Q8C5N3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cwc22Q8C5N3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cwc22Q8C5N3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cwc22Q8C5N3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cwc22Q8C5N3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cwc22Q8C5N3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cwc22Q8C5N3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cwc22Q8C5N3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cwc22Q8C5N3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cwc22Q8C5N3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cwc22Q8C5N3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cwc22Q8C5N3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cwc22Q8C5N3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cwc22Q8C5N3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cwc22Q8C5N3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cwc22Q8C5N3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cwc22Q8C5N3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cwc22Q8C5N3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Cwc22Q8C5N3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cwc22Q8C5N3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cwc22Q8C5N3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cwc22Q8C5N3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cwc22Q8C5N3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cwc22Q8C5N3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cwc22Q8C5N3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cwc22Q8C5N3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Cwc22Q8C5N3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cwc22Q8C5N3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cwc22Q8C5N3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms