Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1Y8

Ccz1, Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccz1Q8C1Y8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccz1Q8C1Y8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccz1Q8C1Y8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccz1Q8C1Y8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccz1Q8C1Y8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccz1Q8C1Y8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccz1Q8C1Y8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccz1Q8C1Y8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccz1Q8C1Y8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccz1Q8C1Y8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccz1Q8C1Y8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccz1Q8C1Y8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccz1Q8C1Y8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccz1Q8C1Y8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccz1Q8C1Y8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccz1Q8C1Y8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccz1Q8C1Y8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms