Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nek11Q8C0Q4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nek11Q8C0Q4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nek11Q8C0Q4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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