Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX35

Eda2r, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 27, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eda2rQ8BX35 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eda2rQ8BX35 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eda2rQ8BX35 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Eda2rQ8BX35 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eda2rQ8BX35 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eda2rQ8BX35 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eda2rQ8BX35 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eda2rQ8BX35 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eda2rQ8BX35 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eda2rQ8BX35 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eda2rQ8BX35 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eda2rQ8BX35 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eda2rQ8BX35 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eda2rQ8BX35 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eda2rQ8BX35 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eda2rQ8BX35 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eda2rQ8BX35 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eda2rQ8BX35 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Eda2rQ8BX35 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms