Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lmod1Q8BVA4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 250.5 ms