Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUE1

Slc9a4, Sodium/hydrogen exchanger 4, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a4Q8BUE1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc9a4Q8BUE1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a4Q8BUE1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms