Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ33

Ticrr, Treslin, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TicrrQ8BQ33 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TicrrQ8BQ33 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TicrrQ8BQ33 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TicrrQ8BQ33 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms