Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Necab1Q8BG18 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms