Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Otop3Q80UF9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Otop3Q80UF9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Otop3Q80UF9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms