Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SnphQ80U23 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SnphQ80U23 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnphQ80U23 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnphQ80U23 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnphQ80U23 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnphQ80U23 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SnphQ80U23 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SnphQ80U23 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SnphQ80U23 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnphQ80U23 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnphQ80U23 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnphQ80U23 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SnphQ80U23 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SnphQ80U23 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SnphQ80U23 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SnphQ80U23 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms