Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnphQ80U23 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SnphQ80U23 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SnphQ80U23 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnphQ80U23 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnphQ80U23 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnphQ80U23 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnphQ80U23 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SnphQ80U23 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SnphQ80U23 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SnphQ80U23 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnphQ80U23 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnphQ80U23 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnphQ80U23 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SnphQ80U23 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SnphQ80U23 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SnphQ80U23 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SnphQ80U23 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms