Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snd1Q78PY7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snd1Q78PY7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms