Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms