Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rph3alQ768S4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rph3alQ768S4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rph3alQ768S4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms