Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc88cQ6VGS5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms