Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDN3

Mylk, Myosin light chain kinase, smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MylkQ6PDN3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MylkQ6PDN3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MylkQ6PDN3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MylkQ6PDN3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MylkQ6PDN3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MylkQ6PDN3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MylkQ6PDN3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.2 ms