Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3a2Q62203 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3a2Q62203 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms