Protein–RNA interactions for Protein: Q61626

Grik5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik5Q61626 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grik5Q61626 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grik5Q61626 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grik5Q61626 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grik5Q61626 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grik5Q61626 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grik5Q61626 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grik5Q61626 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grik5Q61626 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grik5Q61626 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grik5Q61626 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grik5Q61626 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grik5Q61626 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grik5Q61626 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik5Q61626 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik5Q61626 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik5Q61626 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik5Q61626 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik5Q61626 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grik5Q61626 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grik5Q61626 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms