Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarcd1Q61466 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcd1Q61466 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcd1Q61466 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms