Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Psmb6Q60692 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb6Q60692 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms