Protein–RNA interactions for Protein: Q60676

Ppp5c, Serine/threonine-protein phosphatase 5, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp5cQ60676 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp5cQ60676 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp5cQ60676 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp5cQ60676 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp5cQ60676 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp5cQ60676 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp5cQ60676 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp5cQ60676 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp5cQ60676 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp5cQ60676 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp5cQ60676 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp5cQ60676 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp5cQ60676 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp5cQ60676 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp5cQ60676 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp5cQ60676 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp5cQ60676 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp5cQ60676 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp5cQ60676 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp5cQ60676 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ppp5cQ60676 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppp5cQ60676 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms