Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp13a3Q5XF89 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp13a3Q5XF89 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms