Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX39

Myh4, Myosin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh4Q5SX39 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Myh4Q5SX39 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myh4Q5SX39 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Myh4Q5SX39 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Myh4Q5SX39 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Myh4Q5SX39 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Myh4Q5SX39 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myh4Q5SX39 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh4Q5SX39 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms