Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tsr1Q5SWD9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tsr1Q5SWD9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsr1Q5SWD9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms