Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fbxo39Q5NBU5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo39Q5NBU5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms