Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZK1

Cep44, Centrosomal protein of 44 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep44Q5HZK1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cep44Q5HZK1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cep44Q5HZK1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cep44Q5HZK1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cep44Q5HZK1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cep44Q5HZK1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cep44Q5HZK1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cep44Q5HZK1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cep44Q5HZK1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cep44Q5HZK1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cep44Q5HZK1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cep44Q5HZK1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cep44Q5HZK1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cep44Q5HZK1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cep44Q5HZK1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep44Q5HZK1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms