Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prkaa1Q5EG47 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkaa1Q5EG47 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms