Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syne3Q4FZC9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syne3Q4FZC9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms