Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
6430531B16RikQ3V2J1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
6430531B16RikQ3V2J1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
6430531B16RikQ3V2J1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
6430531B16RikQ3V2J1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430531B16RikQ3V2J1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms