Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
4930567H17RikQ3V0K5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4930567H17RikQ3V0K5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
4930567H17RikQ3V0K5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930567H17RikQ3V0K5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms