Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C87499Q3UX49 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C87499Q3UX49 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C87499Q3UX49 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms