Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Capn13Q3UW68 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn13Q3UW68 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms