Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim15Q3UTD9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms