Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQU0

Brd9, Bromodomain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd9Q3UQU0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brd9Q3UQU0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brd9Q3UQU0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Brd9Q3UQU0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brd9Q3UQU0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Brd9Q3UQU0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Brd9Q3UQU0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Brd9Q3UQU0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brd9Q3UQU0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brd9Q3UQU0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brd9Q3UQU0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brd9Q3UQU0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brd9Q3UQU0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Brd9Q3UQU0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brd9Q3UQU0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brd9Q3UQU0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brd9Q3UQU0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brd9Q3UQU0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brd9Q3UQU0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brd9Q3UQU0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brd9Q3UQU0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brd9Q3UQU0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brd9Q3UQU0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.7 ms