Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrch2Q3UMG5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrch2Q3UMG5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.9 ms