Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx6-3Q3UHX8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx6-3Q3UHX8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx6-3Q3UHX8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx6-3Q3UHX8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx6-3Q3UHX8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx6-3Q3UHX8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx6-3Q3UHX8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Nkx6-3Q3UHX8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Nkx6-3Q3UHX8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkx6-3Q3UHX8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
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