Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy4Q3TYX8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms