Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc138Q0VF22 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc138Q0VF22 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccdc138Q0VF22 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms