Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rundc1Q0VDN7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rundc1Q0VDN7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Rundc1Q0VDN7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rundc1Q0VDN7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms