Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah2Q06986 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms