Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprgQ05909 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprgQ05909 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprgQ05909 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprgQ05909 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprgQ05909 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprgQ05909 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprgQ05909 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprgQ05909 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprgQ05909 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprgQ05909 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprgQ05909 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprgQ05909 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PtprgQ05909 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.9 ms