Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pfdn6Q03958 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pfdn6Q03958 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pfdn6Q03958 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms