Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gfra1P97785 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms