Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pitx2P97474 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms