Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ElocP83940 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ElocP83940 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ElocP83940 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ElocP83940 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ElocP83940 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ElocP83940 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ElocP83940 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ElocP83940 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ElocP83940 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ElocP83940 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ElocP83940 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ElocP83940 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ElocP83940 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ElocP83940 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ElocP83940 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ElocP83940 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ElocP83940 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ElocP83940 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ElocP83940 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ElocP83940 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ElocP83940 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ElocP83940 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ElocP83940 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ElocP83940 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ElocP83940 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ElocP83940 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ElocP83940 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ElocP83940 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ElocP83940 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ElocP83940 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ElocP83940 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ElocP83940 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ElocP83940 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ElocP83940 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ElocP83940 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ElocP83940 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ElocP83940 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ElocP83940 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ElocP83940 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ElocP83940 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ElocP83940 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ElocP83940 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ElocP83940 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ElocP83940 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ElocP83940 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ElocP83940 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ElocP83940 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ElocP83940 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ElocP83940 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ElocP83940 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ElocP83940 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ElocP83940 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ElocP83940 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ElocP83940 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ElocP83940 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ElocP83940 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ElocP83940 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ElocP83940 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ElocP83940 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ElocP83940 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ElocP83940 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ElocP83940 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ElocP83940 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ElocP83940 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ElocP83940 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ElocP83940 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ElocP83940 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ElocP83940 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ElocP83940 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ElocP83940 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ElocP83940 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ElocP83940 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ElocP83940 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ElocP83940 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ElocP83940 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ElocP83940 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ElocP83940 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ElocP83940 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ElocP83940 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ElocP83940 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ElocP83940 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ElocP83940 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ElocP83940 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ElocP83940 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ElocP83940 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ElocP83940 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ElocP83940 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ElocP83940 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ElocP83940 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ElocP83940 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ElocP83940 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ElocP83940 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ElocP83940 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ElocP83940 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ElocP83940 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ElocP83940 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ElocP83940 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ElocP83940 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ElocP83940 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms